由于地埋滴灌的灌溉毛管埋設(shè)在地下30厘米以下，使得人們無法直接觀測到灌水器出流狀況和灌水效果，只有等到作物出現(xiàn)了旱象或地面出現(xiàn)“泉眼”時才能發(fā)現(xiàn)。同時為防止灌溉水中雜質(zhì)引起的灌水器堵塞以及在停止灌溉的短時間內(nèi)滴頭出現(xiàn)負壓堵塞等問題，必須增加過濾系統(tǒng)的過濾精度和增加相應(yīng)的附加設(shè)備，并在每次灌溉結(jié)束后對管路進行沖洗。地下滴灌系統(tǒng)需要進行檢修時，要比膜下滴灌系統(tǒng)投入更多的時間，耗費更多的人力物力，同時運行管理費用也相對較高，如果設(shè)計、施工、安裝等管理環(huán)節(jié)上出現(xiàn)問題，所謂的優(yōu)點將大打折扣。

1、出苗水無保證，棉苗出苗差

通過6年的應(yīng)用情況看，采用地下滴灌技術(shù)的作物一定要適墑播種，一旦土壤出現(xiàn)缺墑，將發(fā)生出苗困難的情況，即便是采取滴水出苗，其效果也非常差。如果土壤含鹽量稍大的，采用滴水補墑后，由于土壤毛細管的作用，其水分蒸發(fā)后鹽份積累在地表和種子周圍，使種子發(fā)生鹽害。同時由于毛管是埋在30厘米以下，最少需要滴50—60立方/畝的水才能使水份上移。從應(yīng)用情況表明，采用地埋滴灌方式種植的棉花條田，出苗情況遠不如膜下滴灌和軟管灌和常規(guī)灌的棉田出苗好。

2、土壤的適宜性問題

由于毛管是埋在地下30厘米以下，灌溉水通過毛管滴頭緩慢滲入附近的土壤，然后在借助土壤毛細管的作用和重力的作用擴散和上升到作物耕層的。而土壤毛細管作用力的大小是和土壤的質(zhì)地有著密切的關(guān)系。從沙土、壤土到粘土，壤土的毛細管作用力最大，毛細管作用力越大，在灌水量相同的情況下，其土壤水分向周邊擴散的范圍就越大，不容易形成重力水下滲或形成積水，反之情況相反。

3、地下滴灌的施工安裝及滴灌帶的鋪設(shè)埋深問題

好的滴灌工程，必須要有好的設(shè)計，還更應(yīng)該有好的施工和安裝。尤其是地下滴灌系統(tǒng)滴灌帶的鋪設(shè)和安裝十分重要。為保證滴灌帶不被耕作破壞，從理論上講滴灌帶應(yīng)埋設(shè)在犁底層以下5cm，因此對田快的平整度及耕作的質(zhì)量要求應(yīng)該是非常嚴格的。對進行地下滴灌的條田地塊，應(yīng)該先進行土地平整，鋪設(shè)時要保持滴灌帶的埋深一致，在條田的兩頭應(yīng)事先用人工挖好溝曹，對埋設(shè)深度不夠的局部進行人工扶助。即便使這樣，幾年來采用地下滴灌的條田，均存在著滴灌帶被犁斷破壞的現(xiàn)象，有部分系統(tǒng)就是因為毛管被犁斷的太多而不能使用，第二年就改為膜下滴灌了。另外，滴灌帶與支管的連接也非常重要，要避免出現(xiàn)滴灌帶打折的現(xiàn)象，否則將影響作物的生長發(fā)育。另外，地下滴灌系統(tǒng)的滴灌帶埋設(shè)工作應(yīng)在秋季完成，鋪設(shè)完成后最好進行一次灌溉，即可以達到洗鹽或儲水灌的效果，又可以對開溝埋設(shè)滴灌帶而發(fā)生擾動的土層進行密實。因為春季播期緊張，如進行埋管作業(yè)易使棉田跑墑影響播期，同時對出苗也會產(chǎn)生不利影響。

4、鹽堿積累和返鹽問題

采用膜下滴灌技術(shù)在灌溉時，因重力的作用，水分是向下運動的，在土壤濕潤范圍內(nèi)將鹽堿排到濕潤區(qū)的外圍既2條滴灌帶的中間和濕潤深度的下方，使植物的根系在一個相對的弱鹽區(qū)，這也是水鹽運移規(guī)律。而地埋滴灌由于其滴灌帶是埋在地表以下35—40厘米處，水分的上升是通過土壤毛細管的作用來上升的，隨著水分的蒸發(fā)，鹽分向表層的聚集是不可避免的，因此在苗期對作物的生育影響是非常明顯的。在兵團6年的生產(chǎn)實踐中，由于土壤墑度不夠，而采用地下滴灌補水出苗(灌溉60--70立方/畝)的，其結(jié)果造成地表大面積集形成鹽絨堿斑;使田塊中鹽分的上升而造成了棉種因鹽害而不發(fā)芽或棉花出苗明顯低于其他灌溉形式的棉花出苗率。同時在6月底前，采用地下滴灌的作物其發(fā)育情況明顯低于采用膜下滴灌技術(shù)或軟管灌溉技術(shù)的作物長勢。

5、植物根系入侵堵塞和鼠害問題

為了減少投資，在地下滴灌系統(tǒng)毛管的選擇上基本上選用了薄壁滴灌帶。這就存在兩方面的問題：一是植物根系的入侵，已經(jīng)出現(xiàn)了蘆葦穿透毛管壁進入滴灌帶并沿滴灌帶水平生長情況，且滴灌帶有多處被蘆葦?shù)姆植娓檀?還有植物的根系造成的滴頭堵塞問題。二是鼠害問題，由于是薄壁管，在一些田鼠比較多的條田，滴灌帶被老鼠咬破的現(xiàn)象時有發(fā)生，因而影響系統(tǒng)的正常工作。

6、地下滴灌帶毛管鋪設(shè)間距的問題

一些材料供應(yīng)商為了推銷其產(chǎn)品，他們根據(jù)業(yè)主盡可能的降低地下滴灌系統(tǒng)投資的心情，提出了按照膜下滴灌的滴灌帶配置形式，采用1管4行來減少地下滴灌帶的用量來減少投資。以機采棉為列，作物栽培模式為66+10+66+10+60，即兩行棉花(小行)間距10厘米，大行為66厘米，小行10厘米，連接行為60厘米。滴灌帶按照一管2行鋪設(shè)，即滴灌帶鋪小行之間，滴灌帶的間距為76厘米，畝滴灌帶用量為880米。按照一管4行鋪設(shè)，即滴灌帶鋪在大行中間，滴灌帶的間距為152厘米，畝滴灌帶用量為440米。由于膜下滴灌滴灌帶的鋪設(shè)都是按照這一模式進行的，整體上看效果還比較好。因而在地下滴灌系統(tǒng)的建設(shè)中，沒有考慮土壤質(zhì)地和作物栽培模式及地下滴灌的特點，無論何種土壤條件一律采用一管4行的模式，雖然滴灌帶的投資減少了一半，但其后果就是作物生長非常不均，大小苗現(xiàn)象嚴重。這也是應(yīng)用6年來，地下滴灌面積大幅度減少的一個主要原因。

7、播種行與毛管鋪設(shè)行錯位

為了降低投資，許多團場采用152厘米的滴灌帶間距進行地下滴灌設(shè)計，這也與兵團推行的機采棉棉花的栽培株行距66cm+10cm或60cm+16cm是相配套的，毛管的位置剛好在棉花大行的中間，實現(xiàn)一管四行。但在播種時，應(yīng)不確切地埋滴灌帶的位置，容易造成地下毛管的位置和地上棉花行間不一致，部分毛管并非正好處于棉花大行的中間。其結(jié)果是反映到生長季節(jié)棉花行間生長不一致，存在高低苗的現(xiàn)象。解決這一問題的辦法只有在播種前標定地埋管的準確位置，播種時不斷校正，使毛管位于棉花大行的正中間，但這樣操作將影響播種速度和播期，還容易造成待播的地跑墑